Versión 1 (dada por los operadores del retén): los jóvenes no se detienen y disparan a los militares desde la camioneta, con un arma 9 mm. Los disparos no producen ningún militar herido, pero los jóvenes logran pasar el retén y huyen a toda velocidad en su camioneta. 

 Versión 2: Víctor Manuel y Ramón simplemente se pasan el retén pero sin disparar ni apuntar arma alguna, porque no suelen manejar pistolas ni, que se sepa, tienen una. Los familiares de las víctimas incluso aseguran que no había ningún retén y que los policías y militares viajaban en un convoy durante un operativo.
  

Tras pasarse el retén, los policías y soldados persiguen a los dos amigos hasta la calle que conduce a la central camionera de la ciudad. En un punto de la avenida, los militares disparan con rifles de asalto tipo R-15. Por lo menos 42 tiros salen de las armas de los militares. Víctor Chan recibe 13 impactos de bala en su cuerpo y es una perforación del pulmón lo que le cuesta la vida. Ramón Pérez recibe 18 disparos y su muerte es por una bala que le entra por el cuello hasta las vértebras cervicales.

Consumado el acribillamiento, militares, federales y estatales acordonan la zona e impiden el paso a civiles. El alcalde de Jalpa de Méndez, de nombre Renán López, se presenta en el lugar pero nadie le da mayor información, sólo se sabe que ha habido un tiroteo. Según versiones de testigos, el agente del ministerio público llegó a la escena alrededor de las 6:00 de la mañana del domingo, unas cinco horas después de los balazos.

El lunes 15 de noviembre el caso está en los medios nacionales. Los actores se contradicen. La Secretaría de la Defensa Nacional emite un comunicado donde da su versión; en una declaración que sorprende, el Ejército dice que los que dispararon fueron los elementos de la Armada. Horas después, la Armada responde diciendo que si bien hubo marinos presentes en el retén, aún no puede decirse oficialmente quién disparó, porque las investigaciones periciales están en curso.

El martes 16 de noviembre tiene lugar en Jalpa de Méndez una escena desgarradora, por si la ejecución misma no hubiera sido suficiente. Familiares, vecinos y amigos de los jóvenes confrontan a un mando del ejército, al que le exigen una explicación. Un grupo de soldados y policías federales, con máscaras pasamontañas en sus rostros, escucha el llanto de los padres, y sus gritos de reclamo. Los militares no atinan sino a responderles que se tranquilicen, o serán acusados de agredir a la autoridad.

En los primeros días tras el homicidio de los dos jóvenes, la Procuraduría del estado presenta una pistola 9 mm, cartuchos útiles y uno percutido, que dice, encontró en la camioneta de las víctimas. Los padres de los jóvenes rechazan la prueba y dicen que fue sembrada. Para alimentar más las dudas, habrá contradicciones en dos autopsias realizadas a los cadáveres.

La PGJE realizó la primera autopsia inmediatamente tras el hecho, según la cual, tanto Víctor Manuel como Ramón murieron por el sangrado que les ocasionaron sendos impactos de bala en sus tibias.

Meses después, el 2 de mayo de 2011, ante la presión de los padres y la comunidad de Jalpa de Méndez, peritos de la PGR se encargan de exhumar los cuerpos de Víctor Manuel y Ramón para realizarles nuevos estudios.

Estas segundas pruebas determinan que Víctor Manuel murió por perforación de pulmón con  bala, mientras que su amigo Ramón murió por otro proyectil que le entró por la nuca y le afectó la cervical.

Hasta octubre de 2011 no había personas procesadas ni detenidas por la muerte de los dos jóvenes tabasqueños.